截至2023年，据不完全统计，研究所共编写标准33项，其中主编19项、参编11项、修订3项等。编制国家标准9项、水利行业标准11项等。

水文所成立初期参与修订了《设计洪水标准》和《设计洪水计算规范》，为复查中小型水库的设计洪水工作提供了设计依据；进入20世纪80—90 年代，随着我国经济社会迅速发展造成的水资源、水环境问题的不断涌现，先后制定了水系水质的分级以及水资源评价相关标准；21世纪以来，水资源所主编或参编的标准类别进一步丰富和完善，涉及类别包括水资源管理、水利信息化、水生态文明建设、节水型社会建设等多项标准，为我国水利事业规范管理、水利行业高质量发展发挥了重要作用。